Khi nhân loại xây dựng các thuộc địa không gian để phục vụ như một môi trường sống mới và tiến từ Trái đất vào vũ trụ bao la, một ý tưởng đột phá đã hình thành. Để thích ứng với sự mênh mông của không gian, con người sẽ phải tiến hóa. Những con người đã tiến hóa này được gọi là "Newtype".
Khi quá trình thuộc địa hóa không gian bắt đầu, những dấu vết về tiềm năng Newtype đã được quan sát thấy trong số những người di cư vào không gian. Tuy nhiên, mãi đến cuộc Chiến tranh Một Năm, sự tồn tại của Newtype mới được công nhận rộng rãi.
Trong không gian, các thuộc địa này được biết đến với tên gọi "Side", và các Side được đánh số từ 1 đến 7. Một cậu bé tên Amuro Ray, cư dân của Side 7, đã điều khiển mobile suit Gundam của Liên bang Trái đất một cách dễ dàng. Kể từ đó, Amuro đã chiến đấu xuyên suốt Cuộc chiến Một Năm với tư cách là một phi công của Liên bang Trái đất. Sau chiến tranh, Amuro được tôn vinh như một biểu tượng của Newtype.
Trong khi đó, Công quốc Zeon sở hữu một phi công được biết đến với cái tên Char Aznable, "Sao chổi Đỏ", người cũng được coi là một Newtype.
Bị mê hoặc bởi Newtype, Zeon đã thành lập Tổ chức Flanagan và bí mật theo đuổi nghiên cứu. Tổ chức Flanagan bao gồm Tiến sĩ Flanagan và một số trợ lý. Họ đã thành công trong việc khai mở khả năng Newtype của một cô gái tên Lalah Sune và chế tạo các mobile armor (áo giáp di động) được trang bị hệ thống psycommu (một hệ thống vũ khí điều khiển từ xa thông qua sóng não) như Elmeth và Braw Bro. Sau chiến tranh, tổ chức này giải tán và các trợ lý của Tiến sĩ Flanagan tan tác.
Liên bang Trái đất cũng rất quan tâm đến Newtype. Sau chiến tranh, họ đã thành lập các trung tâm nghiên cứu trên khắp hành tinh để đẩy nhanh tiến độ nghiên cứu Newtype vốn đang tụt hậu và nắm quyền kiểm soát chúng. Đúng như dự đoán, nhân sự chủ chốt bắt nguồn từ cựu Tổ chức Flanagan.
Đối với các nhà nghiên cứu, việc liên kết với Zeon hay Liên bang là không quan trọng; tất cả những gì họ cần là các cơ sở nghiên cứu và kinh phí đầy đủ.
Một cơ sở nghiên cứu Newtype đã được thành lập ở Viễn Đông: Phòng thí nghiệm Murasame.
Sau chiến tranh, Amuro nổi tiếng với tư cách là một Newtype, và mọi người cực kỳ quan tâm đến sự tồn tại của Newtype. Trong bối cảnh này, các cơ sở nghiên cứu Newtype khác nhau đã đẩy mạnh nỗ lực giải mã hiện tượng Newtype.
Tuy nhiên, tình hình đã thay đổi chỉ trong vài năm. Lý thuyết Newtype trừu tượng của Amuro đã mất đi sức hút đối với quần chúng. Không có Newtype nào khác xuất hiện để tiếp bước anh, và dần dần, anh bị lãng quên.
Vào khoảng thời gian đó, các cơ sở nghiên cứu Newtype phải đối mặt với một bước ngoặt quan trọng: sự khởi đầu của việc tạo ra Newtype nhân tạo, hay nói cách khác, là sự phát triển của con người được cải tiến, Cyber-Newtype (Newtype-Cơ giới). Nếu Newtype tự nhiên không xuất hiện, sự can thiệp của con người sẽ được sử dụng để tạo ra chúng.
Đây là một yêu cầu mạnh mẽ từ giới lãnh đạo quân sự của Liên bang. Những thành tích của Amuro trong Cuộc chiến Một Năm đã để lại ấn tượng khó phai trong lòng các cựu binh quân đội. Do đó, kỳ vọng vào các phi công Cyber-Newtype rất cao, và các phong trào chống Liên bang Trái đất đang gia tăng trong bối cảnh đó không thể bị phớt lờ.
Trong bối cảnh này, việc tạo ra Cyber-Newtype đã trở thành một vấn đề cấp bách đối với Phòng thí nghiệm Murasame.
Tất cả các cơ sở nghiên cứu đều phải đối mặt với cùng một vấn đề: việc thu thập đối tượng thí nghiệm cho các thử nghiệm Cyber-Newtype là rất khó khăn. Vấn đề không chỉ nằm ở số lượng. Hơn nữa, họ không thể công khai tuyển dụng đối tượng thí nghiệm do rủi ro thất bại cao và các tai nạn chết người. Vì vậy, những đứa trẻ mồ côi chiến tranh không có gia đình là lựa chọn hiển nhiên.
Four nằm trong số các đối tượng thí nghiệm được lựa chọn. Four, người đã gặp rắc rối với một nhóm thanh thiếu niên hư hỏng, đã được đưa vào một cơ sở cải tạo. Đó là khi một thành viên của Phòng thí nghiệm Murasame quan tâm đến cô.
Sau khi trải qua nhiều bài kiểm tra khác nhau và được công nhận có tiềm năng Newtype, Four chính thức trở thành một đối tượng thí nghiệm.
Jill và Amari là những đối tượng thí nghiệm đã tham gia thông qua các con đường khác nhau.
Tại Phòng thí nghiệm Murasame, ba người họ là những đối tượng thí nghiệm duy nhất hiện có. Do đó, việc huấn luyện của họ vô cùng khắc nghiệt và đòi hỏi cao.
